Medzi nimi sú značné rozdielyNízkodusíkové parné kotlya bežné kotly. Hlavné rozdiely spočívajú v technológii spaľovania, emisných ukazovateľoch a prevádzkových požiadavkách. Okrem toho sú kompatibilné s rôznymi environmentálnymi politikami a nemožno ich jednoducho navzájom nahradiť.
Najdôležitejším rozdielom je koncentrácia emisií oxidov dusíka (NOₓ). Bežné kotly využívajú relatívne tradičné metódy spaľovania, pričom emisie NOₓ zvyčajne presahujú 400 mg/m³, čo sťažuje splnenie súčasných prísnych environmentálnych noriem. Naproti tomu nízko-dusíkové kotly dokážu regulovať emisie v rozsahu 30 – 80 mg/m³ optimalizáciou spaľovacej štruktúry (ako je postupné spaľovanie a recirkulácia spalín) alebo použitím technológie plne predzmiešaného spaľovania, ktorá je plne v súlade s miestnymi environmentálnymi požiadavkami.
Ich konštrukcia spaľovacieho systému sa tiež líši. Horáky parných kotlov s nízkym -dusíkom sú presnejšie a vyžadujú presnú kontrolu pomeru zmesi vzduchu- paliva a teploty spaľovania, aby sa znížila tvorba NOₓ pri vysokých teplotách. Na druhej strane, horáky bežných kotlov majú relatívne jednoduchú konštrukciu, zameranú na tepelný výkon so slabou kontrolou presnosti spaľovania.
Okrem toho medzi nimi existujú rozdiely v prevádzkových nákladoch a použiteľných scenároch. Parné kotly s nízkym-dusíkom majú vyššiu počiatočnú obstarávaciu cenu, ale môžu pomôcť vyhnúť sa environmentálnym pokutám a niektoré regióny na ne ponúkajú environmentálne dotácie. Obyčajné kotly majú nižšie obstarávacie náklady, no už sa nedajú použiť v oblastiach s prísnymi ekologickými predpismi. Z dlhodobého-hľadiska sú parné kotly s nízkym obsahom dusíka vhodnejšie pre scenáre vyžadujúce nepretržitú prevádzku, ako je priemyselná výroba a vykurovanie, a stali sa bežnou voľbou podľa politických pokynov.

